Schwarzfrüchtiger Zweizahn ist in fast der gesamten nördlichen Hemisphäre heimisch. Es wurde in Australien, Marokko und auch in Neuseeland eingeführt. Es wächst in feuchten, gestörten Gebieten wie Überschwemmungsgebieten oder Entwässerungsgräben; menschliche Aktivitäten helfen oft beim Wachstum. In Alaska gilt es als invasiv und anderswo im Allgemeinen als Unkraut.

Heimisch in Nordamerika, hat sich Schwarzfrüchtiger Zweizahn in ganz Asien und Europa sowie in Marokko, Neuseeland und Französisch-Guinea ausgebreitet. In mehreren Ländern sowie im US-Bundesstaat Alaska wird sie als invasiv oder als Unkraut definiert und auch in ihrem Heimatgebiet als Unkraut behandelt. In China gilt sie als eine der am weitesten verbreiteten invasiven Arten. Schwarzfrüchtiger Zweizahn wurde ursprünglich als Zierpflanze an einigen Orten eingeführt, aber ihre Samen können leicht durch Wasser oder durch Anheften an Kleidung oder Fell verbreitet werden. Sie kann mit einheimischen Arten konkurrieren und sich hybridisieren. Das manuelle Ziehen der Pflanzen oder Herbizide kann effektive Methoden zur Kontrolle von Schwarzfrüchtiger Zweizahn bieten.

Die beste Jahreszeit zur Entfernung von Schwarzfrüchtiger Zweizahn ist der späte Frühling oder frühe Sommer, bevor die Pflanze blüht und Samen bildet. Dies verhindert, dass zukünftige Saatgenerationen keimen und die Population wiederherstellen. Hier sind einige Methoden zur Entfernung oder Kontrolle: