Kleiner Krokus hat eine moderate Toxizität für Menschen, Hunde und Katzen, wenn es eingenommen wird. Alle Teile enthalten Colchicin, was zu gastrointestinalen Beschwerden, Organversagen und schweren Symptomen führt. Bei Haustieren kann die Einnahme zu Erbrechen, Durchfall, Atemproblemen und Krampfanfällen führen. Sofortige tierärztliche Betreuung ist unerlässlich. Erwachsene sollten Kinder und Haustiere daran hindern, Zugriff auf die Pflanze zu haben, aufgrund ihrer hohen Giftigkeit.