Schwarzer Germer wird aufgrund seiner attraktiven Samenkapseln und dunklen Blüten als Zierpflanze verwendet. Diese Pflanze ist jedoch bei Einnahme hochgiftig. Die Reaktionen variieren, können aber in schweren Fällen tödlich sein. Beim Berühren kann sie auch die Haut reizen. Obwohl diese Pflanze nicht offiziell als Unkraut gilt, ermöglicht ihre Fähigkeit, sich durch Rhizome zu verbreiten, die Bildung von Klumpen, die andere Pflanzen verdrängen können. Herbizide wurden verwendet, um unerwünschte Populationen von Schwarzer Germer zu kontrollieren, insbesondere in Weideflächen. Beim Entfernen dieser Pflanze von Hand sollte darauf geachtet werden, direkten Hautkontakt zu vermeiden.