Gingko tiene hojas de forma única, en forma de abanico, que son de color verde esmeralda y miden aproximadamente 2-3 pulgadas (5-7.5 cm) de largo. Estas hojas simples y alternas están dispuestas en grupos de tres a cinco y presentan una coloración amarilla distintiva en otoño. Las venas son dicotómicas, lo que significa que se bifurcan repetidamente en pares. Este patrón de venas, junto con la forma de abanico, hace que las hojas sean fácilmente identificables. La textura es lisa y el margen de la hoja suele ser ligeramente ondulado.

Gingko no produce flores tradicionales pero tiene estructuras de reproducción distintivas. Las plantas masculinas tienen pequeños conos de polen alargados, generalmente amarillentos, que miden aproximadamente 0.5-1 pulgada (1-2.5 cm) de longitud. Las plantas femeninas producen 1-2 óvulos en pedúnculos cortos, que se desarrollan en semillas con un exterior carnoso. No hay pétalos, aroma o periodo de floración similar al de las plantas con flores, ya que la fertilización ocurre a través de espermatozoides móviles, reflejo de su linaje antiguo.

El tallo de gingko presenta una apariencia distintiva y estratificada con un patrón imbricado. Es típicamente de color marrón grisáceo claro, que se oscurece con la edad. La textura es áspera y estriada, especialmente en tallos maduros. Los tallos pueden alcanzar un grosor de 0.4-1 pulgada (1-2.5 cm) y exhiben un patrón de ramificación monticulado y agudo, contribuyendo a un hábito de crecimiento algo irregular pero elegante. Estas características ayudan a distinguir a gingko de otras especies de árboles.

Las estructuras reproductivas de gingko se asemejan a frutas y consisten en semillas con una apariencia distintiva. Presumen un tamaño similar al de las ciruelas y están envueltas en una capa exterior carnosa de color amarillo-naranja que generalmente emite un fuerte y desagradable olor cuando están maduras. Encerrada dentro de esta capa hay una pared interna dura, lisa y de color crema. Cuando maduran, estos pseudo-frutos caen al suelo, a menudo creando una exhibición desordenada. Son notables por su coloración específica y sus características olfativas.