Les feuilles et les tiges du eupatoire rugueuse contiennent du trémétol, un composé hautement toxique. La consommation accidentelle de la plante proprement dite est rare. Cependant, le lait et la viande de bovins qui ont mangé la plante contiennent la toxine, qui est ensuite transmise aux humains qui consomment ces produits. Lorsqu'il est ingéré en grande quantité, une maladie appelée maladie du lait peut survenir.
Les symptômes comprennent une perte d'appétit difficile, des tremblements musculaires, une faiblesse, des vomissements et un coma. Il y a eu de nombreux cas de maladie du lait dans l'est des États-Unis qui ont entraîné des décès, il est donc important de consulter un médecin si vous pensez que vous pourriez avoir une intoxication par le eupatoire rugueuse