Souchet difforme peut être géré par tirage manuel et travail du sol. Il est préférable de l'enlever tôt, avant que les plantes ne mûrissent et ne produisent des graines. Cela peut être assez compliqué dans les régions tropicales, car souchet difforme peut germer et fleurir tout au long de l'année dans ces régions. La lutte chimique est également une option, mais gardez à l'esprit que l'application d'herbicides n'est pas conseillée dans les habitats aquatiques en raison de leur effet toxique sur la faune et la flore aquatiques. De bonnes pratiques de gestion des mauvaises herbes et la garantie d'un établissement et d'un développement sains des cultures peuvent réduire considérablement les effets négatifs de cette plante dans les champs cultivés. Si vous optez pour le contrôle chimique, consultez d'abord un expert agricole pour déterminer quel composé actif est le meilleur pour votre zone géographique. Lisez attentivement les instructions du fabricant sur l'étiquette du produit et effectuez le traitement un jour sans vent pour éviter la dérive.