Comme d'autres mauvaises herbes vivaces similaires, centaurée de russie est le plus souvent gérée en épuisant les sources de nourriture dans ses racines. Cela se fait en enlevant les parties aériennes de la plante par coupe, tonte, hersage, etc. plusieurs fois pendant la saison, surtout avant que la plante ne produise des fleurs et des fruits. Centaurée de russie est une plante très persistante, donc cela peut être une bataille continue. Pour cette raison, il est conseillé de planter également des graminées vivaces qui peuvent concurrencer centaurée de russie et réduire son potentiel de propagation.
L'utilisation d'herbicides n'est pas conseillée. Il existe également certains agents biologiques qui peuvent être utilisés pour le contrôle de centaurée de russie (par exemple la guêpe à galles Aulacidea acroptilonica, la cécidomyie Jaapiella ivannikovi). Si vous optez pour des biopesticides, consultez un expert agricole pour savoir quelle est la meilleure espèce pour votre région géographique.