Ninfea comune è moderatamente tossica per gli esseri umani, cani e gatti, principalmente attraverso l'ingestione. L'intera pianta, comprese radici, fusti, foglie e fiori, contiene gli alcaloidi nupharina e nymphaeine, causando sintomi come nausea, vomito, vertigini e, nei casi gravi, tremori o alterazioni dello stato mentale. È imperativo ricevere immediatamente assistenza veterinaria o medica in caso di ingestione per prevenire seri rischi per la salute.