キバナツメクサの葉は複葉で、2〜3枚の小さな小葉で構成されており、各小葉の長さは約0.4〜0.8インチ（1〜2 cm）です。小葉は楕円形から長楕円形で、縁がわずかに湾曲しています。上面は中緑色で滑らか、光沢があることがあります。葉脈は羽状で、小葉の先端に向かって収束します。この三小葉の配置は識別の重要な特徴であり、そのサイズや微妙な湾曲は他の似た植物と異なります。

キバナツメクサの花は小さく、黄色で、5月から10月にかけて3〜15の花が房状に現れます。各花は5枚の花弁を持ち、成熟するにつれて黄色がかった茶色に変わります。花は自家受粉であり、雄性と雌性の生殖器官を持っています。これらの特徴は特にキバナツメクサの花を識別する助けとなり、通常は直径約0.2インチ（5 mm）の特徴を持ちます。

キバナツメクサの茎は柔軟で、地面に沿って横たわるか、直立することができます。姿勢は弱々しく、または上向きで、稀に毛があります。質感は比較的滑らかで、色は緑色です。茎の厚さは約0.1〜0.2インチ（2.5〜5 mm）です。茎は単一であるか、最小限の分枝を示し、識別に重要です。この姿勢の適応力は茎の顕著な特徴です。

キバナツメクサの果実は小さく目立たず、硬化したエンドウ豆のような構造内に1つの種子を保持します。果実が成熟すると、淡褐色から濃褐色を保ち、表面は滑らかで硬いです。サイズは約0.08〜0.12インチ（2〜3 mm）です。特にキバナツメクサに固有の特徴として、果実は開裂して種子を放出することなく、乾いた萼の中に保持されます。この単純な形状、包まれた種子、開裂しないことは、この植物の識別を助ける重要な特徴です。