Met matige toxiciteit bevat de kleinbladige klimop giftige saponinen in de bladeren en stengels. Onjuiste inname kan symptomen veroorzaken zoals ademhalingsmoeilijkheden, coma, convulsies en zelfs de dood. Kinderen zijn hier bijzonder vatbaar voor, met slechts 2-3 zaden genoeg om vergiftigingsverschijnselen te veroorzaken en onmiddellijke medische aandacht vereist. Direct huidcontact met het sap van de plant kan ook brandwonden en dermatitis veroorzaken. Kinderen die in de verleiding komen om van de zaden van de plant te snacken, lopen het grootste risico op vergiftiging, terwijl volwassenen die met de plant in de tuin werken, zonder handschoenen te dragen, gemakkelijk huidirritaties kunnen ervaren.