Witte waterlelie is gematigd toxisch voor mensen, honden en katten, voornamelijk door inname. De hele plant, inclusief wortels, stelen, bladeren en bloemen, bevat de alkaloïden nupharine en nymphaeine, wat symptomen kan veroorzaken zoals misselijkheid, braken, duizeligheid en in ernstige gevallen, tremoren of veranderde mentale toestanden. Directe veterinaire of medische zorg is noodzakelijk als inname plaatsvindt om ernstige gezondheidsrisico's te voorkomen.