При ограниченном размере засорения лучший способ удалить чистяк весенний – выдернуть все экземпляры из земли целиком. Необходимо обязательно выкопать и клубни, посколько растение может размножаться вегетативным способом и будет продолжать пускать ростки из оставшихся в земле клубней или частей растения. При крупном размере заражения рекомендуется использовать химические пестициды. Не используйте для истребления этого растения такие гербициды, как глифосат, поскольку чистяк весенний растет на влажных участках, где вероятно распространение или вымывание пестицидов в почву, что приведет к воздействию активного компонента на другие виды растений, которые не являлись его целью.