Duftender Seidelbast enthält eine Fülle giftiger Chemikalien und ist daher für Menschen und einige Haustiere äußerst giftig. Die aktiven Chemikalien Mezerein und Daphnin, Verbindungen (Ester), die in allen Teilen der Pflanze enthalten sind. Die Früchte sind besonders reich an diesen Chemikalien und stellen daher die größte Bedrohung für Mensch und Tier dar. Wenn Kinder von dem atemberaubenden Aussehen der Beeren und des Duftes der Pflanze angezogen werden, werden sie dazu verleitet, etwas davon zu essen. Nach dem Verzehr können die Nebenwirkungen der Chemikalien innerhalb weniger Stunden auftreten. Verbrennungen und Schwellungen im Mund, vermehrter Speichelfluss und Übelkeit sind einige milde Symptome. Schwerwiegender sind Erbrechen, erhöhte Herzfrequenz, Schwindel, Durchfall und starke Bauchschmerzen.