Gewöhnlicher Natternkopf ist in Europa und Nordwestasien heimisch. Es wurzelt in Weiden und Straßenrändern in den USDA-Zonen 3 bis 8. Es gilt in über achtzehn Ländern als invasiv, darunter Australien, Russland, Weißrussland, Südafrika und die Vereinigten Staaten. In den USA gilt die Pflanze in Alaska, Wyoming, Idaho, Utah und West Virginia als invasiv. In solchen Gebieten bildet Gewöhnlicher Natternkopf Bestände, die das Wachstum einheimischer Vegetation hemmen. Kontakt kann Dermatitis verursachen, und wiederholtes Verschlucken kann aufgrund der Pyrrolizidinalkaloide der Pflanze im Laufe der Zeit das Vieh vergiften. Gewöhnlicher Natternkopf sät sich schnell wieder aus, aber wenn nötig, können die Blütenspitzen entfernt werden, um die Vermehrung zu verhindern.