Las hojas de ruda son distintivas, con una apariencia suave azul-verde y aromáticas cuando se magullan. Están profundamente lobuladas y divididas 2-pinnadamente, asemejándose a los helechos. Cada hoja tiene puntos glandulares, contribuyendo a su textura y apariencia únicas. Las hojas compuestas tienen un sabor amargo. En cuanto a la forma, están intrincadamente divididas, proporcionando un aspecto delicado y similar a los helechos. Esta división se extiende hasta pequeños lóbulos puntiagudos, con una longitud generalmente alrededor de 2-4 pulgadas (5-10 cm).

Las flores de ruda se caracterizan por sus pequeños pétalos de color amarillo apagado. Dispuestas en racimos terminales y erguidos, estas flores de 5 pétalos rodean un ovario superior verde. Cada flor mide aproximadamente 0.2 pulgadas (5 mm) de diámetro. Los pétalos son en forma de cuchara y, aunque individualmente insignificantes, colectivamente forman una apariencia distintiva. Estas flores emiten un fuerte aroma herbal y típicamente florecen desde finales de la primavera hasta principios del verano, convirtiéndose en una característica clave para la identificación durante este periodo.

Los tallos de ruda comienzan como blandos, verdes y tiernos, encarnando la vitalidad del nuevo crecimiento. A medida que envejecen, estos tallos se endurecen gradualmente y adquieren una textura leñosa. Generalmente son delgados, midiendo alrededor de 0.1-0.5 pulgadas (0.25-1.27 cm) de grosor. El patrón de ramificación es generalmente escaso y simpodial, con hojas alternas a lo largo del tallo. Los tallos maduros y leñosos proporcionan soporte estructural y exhiben una corteza oscura y rugosa, distinguiéndolos de los tallos más jóvenes y lisos.

El fruto de ruda es una cápsula marrón, redonda a ovalada, que madura mostrando una característica dehiscente única: se divide en cinco partes separadas. Dentro de estas divisiones, se revelan varias semillas pequeñas y oscuras. La textura superficial del fruto es generalmente lisa. Cada cápsula mide aproximadamente 0.5 pulgadas (1.27 cm) de tamaño, y las semillas dentro son numerosas. Estas características hacen que el fruto sea visualmente distintivo y contribuyen a la identificación de ruda.