クロガラシ（黒芥子）の葉は最大で長さ10インチ（25センチ）、幅3インチ（7.5センチ）まで成長します。下部の葉は切れ込みがあり、上面には剛毛の短い白い毛が生えた倒卵形で、裏面は中央の葉脈に沿って少しだけ毛が生えています。上部の小さな葉は披針形または楕円形です。茎を上に移動するにつれて、葉の形状は下部の切れ込みのある葉から上部の披針形または楕円形の葉へと変化します。

クロガラシ（黒芥子）の花は約1/3インチ（8ミリ）の小さな明るい黄色の花で、総状花序に最大2フィート（60センチ）まで並んでいます。それぞれの花には4枚の花弁があります。これらの花は最大で2か月間持続し、その視認性を高めます。花は均一に黄色であり、愛好家にとっての識別点となります。その整然とした花弁の配置と長い開花期間が特徴ですが、特筆すべき香りは通常言及されていません。

クロガラシ（黒芥子）の茎は通常、鈍い灰色/緑色で、一般的には枝分かれしません。滑らかな質感を持ちますが、基部にまばらに硬い毛が生えていることがあります。この植物の茎はあまり枝分かれしないため、スリンダーでシンプルな外観を保っています。太さには変化があり、一般的に頑丈な構造を持っているため、識別の特徴となります。基部の毛が上部の滑らかさに対して独特の触覚要素を加えます。

クロガラシ（黒芥子）の果実は、植物の茎に密着する約0.67インチ（1.7センチ）の狭い莢です。この莢は徐々に先細りになります。成熟すると乾燥した質感を示し、通常は種子を放出するために裂けます。成熟した莢の色は、乾燥するにつれて緑色から黄褐色または茶色に変わります。これが成熟度の判断基準であり、識別の特徴となります。