Las hojas de cerezo japonés son alternas y simples, midiendo de 5 a 12 cm (2 a 5 pulgadas) de longitud y de 3 a 5 cm (1.25 a 2 pulgadas) de ancho. Son ovadas a lanceoladas con márgenes serrados. La base varía de cuneada a redondeada mientras que el ápice es acuminado. Los peciolos presentan de 2 a 4 glándulas. El nuevo crecimiento aparece rojo y bronce, pasando a verde oscuro en la superficie superior y verde más pálido debajo. En otoño, el follaje se vuelve rojizo a amarillo.

Las flores de cerezo japonés son notables por su delicada belleza. Típicamente florecen desde finales de marzo hasta abril, apareciendo en racimos de 3 a 5 flores. Cada flor mide aproximadamente 3.8 cm (1.5 pulgadas) de ancho, y los pedicelos que las sostienen pueden tener hasta 3.8 cm (1.5 pulgadas) de longitud. Las flores exhiben una gama de colores que incluyen rosa pálido, rosa, y rosa intenso, y pueden ser dobles o semi-dobles dependiendo del cultivar.

El tallo de cerezo japonés se caracteriza por ramas medianamente gruesas de un distintivo color marrón rojizo, realzadas con lenticelas para el intercambio de gases. La textura de la superficie es relativamente lisa, proporcionando una experiencia táctil única. El patrón de ramificación es regular, y notables yemas grandes están prominentemente posicionadas a lo largo de los tallos, insinuando un crecimiento futuro. Típicamente, los tallos mantienen un grosor manejable, lo que los hace identificables en configuraciones hortícolas. Estas características contribuyen colectivamente a la silueta reconocible de la planta.

El fruto de cerezo japonés es una pequeña drupa esférica con un tono negro brillante. Típicamente, estos frutos miden entre 8 y 13 mm (0.3 a 0.5 pulgadas) de diámetro. Maduran y se vuelven notorios en la última parte del verano. La carne de la drupa abarca una piedra central dura que contiene la semilla. Aunque no sobresalen por su sabor o tamaño, estos frutos son visualmente distintivos, ofreciendo un contraste contra el follaje de cerezo japonés.